ФГБОУ ВО Южно-Уральский ГАУ объединил три высших учебных заведения аграрного профиля Челябинской области: Институт ветеринарной медицины (до 30.06.2015 «Уральская государственная академия ветеринарной медицины» — УГАВМ г. Троицк), Институт агроинженерии (до 30.06.2015 «Челябинская государственная агроинженерная академия» — ЧГАА г.Челябинск) и Институт агроэкологии (ИАЭ, село Миасское Красноармейского района).
Отныне обучающиеся этих институтов имеют статус студентов Южно-Уральского ГАУ, а их выпускники с 2016 г. будут получать государственные дипломы аграрного университета.